地域のニーズが高い内科、小児科、外科、産婦人科、救急科、総合診療が推奨診療科とされています。他の診療科も選択可能ですが（眼科、皮膚科、耳鼻咽喉科など）、地域でのニーズが限られる科の場合、指定医療機関でのポストが不足し、円滑に勤務できない可能性があるため、専攻医登録前にセンターと十分な調整が必要です。場合によっては人数制限が設けられることもあります。

妊娠・出産・育児などの理由がある場合、就業年限を一時中断できます。期間の算入については以下の通りです。

• 就業年限に算入される： 産前産後休暇、育児短時間勤務、病気休暇
• 就業年限に算入されない： 育児休業、介護休暇、休職
• “その他については、自治医科大学卒業医師の取扱いに準じます。”

基本的には県内のプログラムで研修を行いますが、指定医療機関勤務に支障がなく、かつ高度な専門性の習得が必要と認められる場合に限り、3年間を限度として指定医療機関外（県外含む）での勤務が認められることがあります。また、各診療科のサブスペシャルティ領域研修において、県外研修が可能な場合もあります（各科プログラム参照）など。

入局についての制限はありませんが、入局する場合は、自身が地域枠医師でありキャリア形成プログラムに従う必要があることを医局に伝え、事前に沖縄県地域医療支援センターへ申し出る必要があります。必要に応じてセンターが入局に先立って医局と調整を行います。

大学卒業後、指定された臨床研修及び専門研修を修了し、知事が定める指定医療機関で一定期間（原則4年間）勤務することで、修学資金の返還が全額免除されます。

診療科の選択は基本的に自由ですが、地域医療のニーズが高い診療科（内科、小児科、外科、産婦人科など）を推奨しています。一部、地域での勤務が困難な診療科については、センターとの十分な調整が必要です。

当センターでは、卒前の離島医療体験から、赴任後のキャリアサポートまで、一貫した支援体制を整えています。また、ICTを活用した遠隔医療支援や、中核病院との連携により、安心して勤務できる環境づくりを進めています。